Ваш герой находит труп сбежавшего жителя Убежища 101. В его вещях вы нраходите записку, в которой он рассказывает об "Адском месте" в которое он попал. Это место Убежище 66, в котором проводились генетические эксперементы, которые вышли из под контроля. Животные мутировали в новый вид когтей смерти, крысы, обитавшие в канализациях стали больше и кровожаднее, а люди... стали настоящими зверями с жаждой бесконечной крови. Вы отправляетесь в это Убежище и... попадаете в ловушку этих самых "людей". По мере прохождения Убежища вы будете находить записи других жертв Убежища 66. Вашей основной задачей будет выжить, выбраться из Убежища 66 и уничтожить его путем подрыва ядерных реакторов Убежища.